Para fazer baixa de estoque por motivos diferentes de venda, é necessário acessar o menu Produtos > Mais Opções > Baixa de estoque.
Na tela que vai abrir, basta selecionar o produto, o tipo da baixa e a quantidade. Caso precisar, ainda pode escrever alguma observação referente a baixa.
Para finalizar, basta clicar em Salvar Baixa:
Conforme for fazendo as baixas, o sistema vai gerando o relatório de baixa de estoque, no qual você consegue conferir o custo total referente a cada tipo de baixa realizada, conforme o período desejado.
Espero ter ajudado e, caso ainda tenha ficado com dúvidas, é só entrar em contato conosco!